Zdroji povodňového ohrožení na území města Česká Skalice jsou přirozené povodně.

Přímým zdrojem ohrožení je Úpa se svými přítoky. Na tocích, které protékají zástavbou je stanovené záplavové území. Na březích se nacházejí v bezprostřední blízkosti obytné objekty.

Město Česká Skalice a obce po toku níže jsou chráněna před povodní a velkými průtoky, odvodem vody z řeky Úpy pomocí rozdělovacího objektu na jezu Zlíč do vodního díla Rozkoš. I přes tento fakt mohou nastat situace, kdy nastane ve městě Česká Skalice povodňová situace. V rámci záplavového území je zde definováno 71 ohrožených objektů při Q100. Nemůžeme vyloučit ani situaci poškození hrází výše od rozdělovacího objektu ani jeho technickou závadu při povodni.

Nelze podceňovat ani změny počasí v posledních letech, kdy situace, která nastala v Jeseníkách 9/2024 se může opakovat nad pohořím Krkonoš. Největší povodně zde jsou datovány z roku 1897. Stejné povodně jako z roku 1897 zasáhli v roce 2010 Jizerské hory s obrovskými škodami. (povodeň v Jizerských horách v roce 1897 a 2010 měla stejné parametry).