Mezi kritická místa se všeobecně řadí mosty, můstky, lávky a zatrubnění toku s nedostatečnou průtočnou kapacitou, případně umělé a živé ploty postavené přes koryto toku. Při snížení průtokové kapacity nebo ucpání dochází k zpětnému vzdutí a vybřežení vody z koryta toku.
Mezi kritická místa můžeme dále řadit i oblasti se zvýšenou pravděpodobností vzniku povodňové situace – místa situovaná velmi nízko nad hladinou blízkých vodních toků a vodních děl, oblasti v bezprostřední blízkosti břehů apod.
Nový Přerov – vodní linie bez určeného správce je po většinu roku suchá. Při intenzivních nebo dlouhotrvajících deštích se naplní a mělké koryto není schopné pojímat vodu a ta se rozlévá mimo koryto. Linie je částečně zatrubněná. Kritický stav je u objektu č. p. 202.
Kounický potok - most: pod soutokem s Oborským p. se nachází problematický hojně využívaný mostek u školek. Zde se na levém břehu nachází hradítko pro napájení Salvátorského rybníka. Samotné vodní dílo i lokalitu mostku je nutné intenzivně monitorovat a zabezpečovat plynulost průtoku. Níže po toku se nachází na levém břehu objekty školek Montano. Případný rozliv ohrožuje provozní, skladovací objekty a výsadbu.
Kounický potok – zástavba po stavidla: v lokalitě se po obou březích nacházejí objekty v bezprostřední blízkosti vodního toku. Je zde nutné mít v patrnosti potenciální ohrožení zdraví a majetku. Za garážemi v blízkosti komunikace vznikl částečně živelně rybníček, který nemá definovanou polohu, nemá manipulační řád a může negativně ovlivnit odtokové poměry níže po toku.
Kounický potok – zástavba v dolním toku: níže je tok veden v regulovaném korytě. V případě vysokých průtoků nebo zpětného vzdmutí jsou ohroženy lokality sousedící s tokem.
Přerovská Hůra: Vznik svahových splachů může zapříčinit ohrožení objektů a komunikací a tím i obyvatel.
Salvátorský rybník: napájení částečně z Kounického p., částečně dešťovou kanalizací. Vodní dílo převádí vody do Zámeckého potoka (Lesy ČR, s. p.).
Kocanda: Tok má sloužit jako sběrnice vod z meliorací ze sousedních pozemků a také sem ústí splachy z lokality Kocanda. V blízkosti se nachází mokřad a místo koncentrace biologického odpadu. Místy je koryto toku neznatelné – v délce cca 70 metrů je zasypáno a zavezeno. Nutný monitoring a udržování plynulosti průtoku.
Záplavové území Labe: rozsáhlé území na levém břehu Labe. V návaznosti na očekávaný rozliv je nutné varování lokality v blízkosti zdymadla (vč. chatové osady) a části Tři Chaloupky. Zabezpečovat průtok pod mostky a podtoky.