Největším ohrožením katastrálního území obce Chvatěruby jsou extravilánové a svahové splachy. Obec je situována v kopci, na jehož relativně rovném vrcholu je mírně se svažující louka směrem zpět k obci. Na louce bezprostředně vedle silnice se nachází sběrné místo, kde byl vybudován odvodňovací systém, který ovšem neplní svou funkci úplně na 100 % (systém měl pobírat přebytečnou vodu, případně ji odčerpat a vyvést stranou od obce). Při nadměrných srážkách či vydatném tání sněhu a naakumulování vody na louce u silnice (III/2429) je část odčerpána odvodňovacím systémem a část přetéká přes silnici. Následně protéká obydlenou zástavbou obce přes její střed a dále dolů směrem k Vltavě. Z kopce stéká voda všemi ulicemi a je odváděna pouze nekapacitními strouhami. V případě větších srážek jsou tedy vyplavovány prakticky všechny domy v těchto ulicích. Problémy se splachy přes obec jsou i v zimních měsících, kdy voda případně protékající obcí zamrzá a na cestách se tvoří nebezpečné vrstvy ledovky.
Dále je obec ohrožena blízkou řekou Vltavou, která se v důsledku dlouhotrvajících nebo přívalových srážek, výjimečně i táním sněhu, může rozvodnit a ohrozit tak domy bezprostředně vedle koryta toku. Nezastavěné okolí Vltavy je rovinaté a tudíž je zde velké rozlivové území.